长江中下游的黄梅天多半是从芒种节气后期开始的。农民对芒种节气的雨水很关心，故流传下来的气象谚语很多。如下：
◇芒种夏至是水节，如若无雨是旱天。(粤)
◇芒种夏至，水浸禾田。(粤)
◇芒种落雨，端午涨水。(湘)
◇芒种夏至常雨，台风迟来;芒种夏至少雨，台风早来。(闽)
◇芒种夏至天，走路要人牵。(苏、皖、川、鄂、贵)(指阴雨天多，行路容易滑倒)
一般来说，在芒种节气后期，从我国的长江流域到日本南部会出现雨期较长的连阴雨天气，因正值梅子黄熟，故称梅雨。古代形容梅雨的诗句要属《千家诗》中，赵师秀《约客》一首最为著名：“黄梅时节家家雨，青草池塘处处蛙。有约不来过夜半，闲敲棋子落灯花。”
根据《长江中下游气候》一书中有关入梅日期的统计：一般武汉是在6月16日、安徽安庆6月15日、南京和上海是6月17日。在湖南、江西、浙江大部，梅雨一般比长江流域来得早几天。但降水日数很少的年份也出现过，气象学上把这段时期没有连续性降水的情况，称为空梅。梅雨之后是长江中下游的伏旱期，如果空梅，这一地区将有可能出现严重的夏旱。
芒种期间，华南汛期虽说处在晚期，依然会有大暴雨。正常情况，一般先进入梅雨期的是湖南、江西中部、浙江南部地区，入梅后如同华南一样，该地区的主汛期开始，时有暴雨发生，山区地区需要警惕局地大暴雨引发的山洪、泥石流等次生灾害。还有城市排除积水、农田排涝和抢救遇难群众，都会列如应急预案之中。
历史上1954、1991和1998年，梅雨期间的暴雨都引发了全流域性的特大洪水。根据国家防汛抗旱总指挥部办公室今年5月发布的洪涝灾害统计，1998年因洪水死亡4150人，损失人民币2550亿元。当然这种情况的形成，一定是冷暖空气势力都较强，势均力敌所致。
另外，西南地区从6月份也开始进入了一年中的多雨季节。此时，西南西部的高原地区冰雹天气开始增多。
在此期间，除了青藏高原和黑龙江最北部的一些地区，还没有真正进入夏季以外，大部分地区的人们，一般来说都能够体验到夏天的炎热。位于黑龙江北部的嫩江，在1971～2000年30年间，最热的一天37.1℃，就出现在芒种期间。
6月份，无论是南方还是北方，都有出现35℃以上高温天气的可能，黄淮地区、西北地区东部可能出现40℃以上的高温天气，但一般不是持续性的高温。
在华南的台湾、海南、福建、两广等地，6月的平均气温都在28℃左右，如果是在雷雨之前，空气湿度大，确实是又闷又热，有时需要向公众发布高温预报，提醒人们预防中暑、空调病和急性肠胃炎。
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